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（试想一个充满BUG的游戏服务器，这个服务器从来不停机维护）这就是大家一再提到的“MATRIX升级“，但是麻烦的是连接在MATRIX上的无数人类生命显然是无法重新启动的，这时对人类情感世界已经有相当了解的MATRIX找到了一个“最经济“的方案，那就是反过来利用错误来消灭错误，并利用错误创造重新启动系统的机会，这个完美的计划就是电影黑客帝国三部曲的全部内容。
以下是我按照电影的情节对这个计划的推理。
这个计划的开端是设立ZION（锡安）这个人类觉醒者的收容所，由于对人类觉醒者的杀戮往往导致更多人的觉醒，与其如此，不如把这些觉醒者踢出系统，并且统一监管起来，ZION 与其说是人类自由的乐土不如说是一个大监狱，为什么这样说，要知道ZION是MATRIX派出的人建立的（位置MATRIX当然是早知道的），而这些人理所当然的成为ZION的领导层，所有人实际上是在MATRIX控制的人监管之下。由于人类是有繁殖能力的，ZION的扩张也是必然的，为了防止ZION因强大而失去控制，所以MATRIX要定期毁灭ZION（举手之劳而已），而这个过程和MATRIX的升级计划合二为一。
第二步是创造一个人类觉醒者所崇拜的“先知“，由于MATRIX对人类长期的研究发现，人类是非常迷信的（人类把这个称为信仰），对“奇迹“还是“圈套“缺乏理性的判断力（有些看电影的人还一直坚持认为先知是在帮助人类。。。。。连看电影的人都被迷惑了。。。。），先让先知给那些“反抗军“少许“甜头“，然后就可以把这些家伙在MATRIX里的行动也控制起来。
实际上电影里无论墨菲斯还是NEO（尼奥）所有的行动都是那个先知提示的，他们在有所行动前已经习惯性的要到先知那里去“批命“，这种精神控制的手法其实一点也不新鲜，人类社会的邪教组织一向都是用这样的手法，区别是邪教一般是用一些小骗术来骗取他人的信任，而这个先知是通过高速电脑事先计算出未来事件的发生（所以这些事都不是一定会发生的，是需要先知这样的角色来引导或诱发才能达成的）来取得人类的信任。
第三步就是给这些ZION的人类创造一个虚幻的希望“THE ONE“（救世主），也就是电影中的主角NEO，他还有一个作用，由于那些逃避删除的程序熟悉MATRIX的操作手法，他们可不会吃“先知“的那套把戏，要对付这些“危险的系统垃圾“也需要借助这个特殊的角色，在电影里，NEO在先知的诱导下（让他去找钥匙人）去踢了法国人的场子，消灭了他很多能力强大的手下。
为什么不消灭法国人，因为法国人起的也是类似ZION的作用，他把逃避删除的程序收集起来当做手下，就象把垃圾扫到垃圾桶里（法国人说白了就是一扫地的），这样才好一次倒掉（由THE ONE来负责一次倒掉），估计每次MATRIX升级都会有个THE ONE听了先知的引导，到法国人这里来打砸一翻，所以法国人对先知的这种手法既痛恨又无奈，这也是他想要挖先知眼睛的原因。
第四步就是开始清理系统内外，这个步骤需要先知的诱导和NEO的强大能力，首先是使NEO获得能力并对先知言听计从，这段过程大概是黑客第一集的内容，然后就是对系统内的逃逸程序进行打击，先知以找钥匙人为诱饵，让NEO一伙和法国人的手下火拼，结果法国人手下全灭。
法国人夫妻出于对这个“游戏“玩法的了解始终没有出过手（不但没出手还提供帮助，法国人老婆在意味不明的一吻后提供了帮助，谁知道不是他们两夫妻事先约好的？），这个过程在电影第二集里有详细描述。最后是对ZION进行清理，消灭ZION所有的战斗力量，早就知道ZION位置的MATRIX不费吹灰之力就把ZION的反抗力量消灭，这些内容在第三集里有详细描写。
最后的一步比较麻烦，就把THE ONE神话毁灭，并排除先知的所有的“嫌疑“，然后在所有在MATRIX里的人类都没有察觉的情况下重新启动MATRIX（我猜想可能是类似于更换一下游戏服务器主机），其中THE ONE这个角色在整个计划中是即必不可少又相当危险的，对这个角色的控制不当会有非常严重的后果（这从黑客3最后建筑师和先知说的那句：“你玩的是非常危险的游戏“可以知道）。
消灭NEO是一个难题，MATRIX对此的对策就是史密斯，在第一集里史密斯只是一个性格古怪个体意识很强的“杀毒程序“，他对MATRIX系统的不满情绪是他被选中成为消灭NEO的人选的原因，因为他最终也是要被消灭的（让错误和错误相互攻击抵消，是这个计划的精华之所在）。
在第一集最后史密斯被NEO消灭后，第二集他又复活并获得了新的能力，很多人把这解释为系统的一个失算的杀毒程序升级，其实智慧那么高的MATRIX控制者怎么会犯那么愚蠢的错误，这肯定是有计划的，史密斯获得能力后的行动也是可以预料的（先知的拿手好戏，不要说先知，就连我看完第二集我就猜到史密斯在第三集里会把全人类给复制了），其实他的作用就是把全人类给复制，然后用他从他人那里吸收来的能力打倒NEO（电影里说的明白是史密斯打倒并吸收了NEO），然后系统把他和NEO删除掉，他的代码从所有人身上消除，所有人都同时昏厥过去，最后MATRIX就抓住这个机会重新了启动。
在这个计划里，ZION的人类傻傻得收集MATRIX里觉醒的人类。法国人也很无奈得收集着逃逸程（不收集的话，就要他自己和THE ONE动手，结果就是。。。。）。MATRIX轻松愉快得清理了系统内外的危险垃圾，这还只是顺便的，重要的是系统得到了重新启动的机会，系统的稳定性得到了保证。这个计划最妙的地方就是可以反复使用，MATRIX就这样一次次得重新启动，ZION就这样一次次的被消灭又重建（电影里这次因该算被消灭了，ZION的战斗力完全没了，杀戮的多少一向不是MATRIX追求的效果），数代THE ONE一次次得出现又陨落，MATRIX就这样安全运行了数个世纪。
大家以为这里就结束了么？
那还往高层次带人呢？嘿嘿！请继续看下去。
一、《Matrix》是什么？
《Matrix》是一部电影，也仅仅只是一部电影……这是讨论的起点，也是由此而引发的所有解释回归的终点。
是电影，就是讲叙一个故事，而不是某种哲学理论的阐释或形象化图解。故事“有开始就有结束“，而故事从开端、发展、高潮到结局的过程中，创作者无论采取何种手段：暗示、比喻、象征等等，都必须服务于一个合理且统一的剧情逻辑，起到渲染气氛、强化悬念、煽动情绪的作用，推动情节发展起伏跌宕，扣人心弦。这，才是一部“好”电影！
以这个标准来衡量，目前市面上流行的种种“郭XX“式的解释和说明，如果不能有助于对剧情以及剧情发展逻辑的理解，即使不算是谬误，也不过是某种阐微发幽的学术研究，冒似深刻，实则离事实本身越来越远。（笔者无意诋毁此前种种“假说“的努力，只是《Matrix》和“Matrix现象“之间确有着本质的区别。）在此，我将以一种顺叙的方式，为大家层层解开《Matrix》最后的真相之迷。
二、故事的背景：《Matrix》前传
“在很久很久以后，在一个机器的国度里……”
一场惨烈的人机大战后，机器最终占领和统治了地球，把人类当做能源的提供来“种植“；与此同时，为了维系人类的繁衍生息，确保能源产量的稳定，机器通过某种机器向人类提供精神生活的假像，这就是Matrix（矩阵）。抛开计算机原理不谈，这里面有两层含义，一，Matrix是机器的机器，用于生产能源，一如人类生产粮食所使用的工具；第二，Matrix得以实现的原因是基于所谓的人类“意识论“（可参考网上各种关于帕拉图哲学的解说）。
Matrix做为生产工具，唯一的衡量标淮是生产效率的提高。The Architect（架构师）设计的第一代Matrix是按人类理想设计的一个完美的世界，原以为人人会安居乐业，但却不想由于人类的劣根性，导致人类（或称“粮食“）大量坏死，于是，The Architect只好按照人类的实际情况设计了一个与现实相符的世界。
即便如此，人类天性中独立、自由的意识仍然不能�